La localización geográfica de los humedales costeros de la Comarca del Campo de Gibraltar es idónea, ya que su disposición abarca el principal frente migratorio del sector español del Estrecho de Gibraltar. La importancia que este Estrecho tiene para la migración de las aves silvestres de Europa Occidental, unido al valor ecológico que poseen las zonas húmedas, hacen que sea necesario conservar adecuadamente estas zonas, cuya localización geográfica y diversidad de biotopos, incluyendo hábitats no palustres, propician la presencia de una interesante y variada comunidad de aves. Estos espacios naturales son los únicos de sus características existentes en el sector español de esta zona migratoria, constituyendo un potencial elemento compuesto que, convenientemente regenerado y preservado, aumentaría enormemente su valor ecológico y su función ornitológica como importante eslabón de las cadenas de humedales costeros de las dos vertientes migratorias que confluyen en el sector español del Estrecho de Gibraltar. La alteración grave de algunos de estos ecosistemas supondría una pérdida importante e irreversible para la avifauna migradora.
En el año 1989 se crearon los Parajes Naturales que afectan a estos humedales, pero aún no han sido aprobados los planes rectores de uso y gestión de los mismos. Actualmente la Junta de Andalucía está elaborando una legislación que regulará los Parajes Naturales de Andalucía y les dotará de un régimen jurídico especial. Mientras, estos humedales están sufriendo diversos impactos y procesos de degradación que disminuyen, lenta pero continuamente, su valor ecológico. En concreto, la desembocadura del río Palmones está siendo afectada o amenazada por varias actuaciones urbanísticas, la mayor parte de ellas sobre llanuras de inundación de su cauce, favorecido ello por la exigua extensión que posee su Paraje Natural.
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